Η Ελένη Κόκκοτου αποφοίτησε από την ιατρική σχολή του Πανεπιστημίου του Novi Sad και υπηρέτησε ως ιατρός υπηρεσίας υπαίθρου στο Περιφερειακό Ιατρείο Κροκεών Λακωνίας. Διετέλεσε συντονιστής ιατρός στους SOS Ιατρούς. Ειδικεύθηκε στην Πνευμονολογία- Φυματιολογία στην 4η Πνευμονολογική Κλινική του ΝΝΘΑ «Η Σωτηρία» και στην Μονάδα Εντατικής Θεραπείας της Α΄ Πανεπιστημιακής Πνευμονολογικής Κλινικής του ίδιου νοσοκομείου. Εργάστηκε ως Πνευμονολόγος στην 4η Πνευμονολογική κλινική. Είναι κάτοχος του μεταπτυχιακού «Ογκολογία Θώρακος: Σύγχρονη κλινικοεργαστηριακή προσέγγιση και έρευνα». Από τον Ιανουάριο 2017 είναι επιστημονική συνεργάτης στην Ογκολογική Μονάδα της Γ΄ Πανεπιστημιακής Παθολογικής Κλινικής του ΝΝΘΑ «Η Σωτηρία». Το Νοέμβριο 2017 έως τον Ιούνιο 2019 εργάστηκε ως Πνευμονολόγος στο Ιδιωτικό Θεραπευτήριο «Υγεία». Από το Νοέμβριο 2019 είναι υποψήφια διδάκτωρ της Ιατρικής Σχολής του Εθνικού Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών. Έχει λάβει μέρος σε σειρά Ελληνικών και Διεθνών Επιστημονικών Εκδηλώσεων. Είναι μέλος της Ελληνικής Πνευμονολογικής Εταιρείας (Ε.Π.Ε), της Ένωσης Πνευμονολόγων Ελλάδος, της European Respiratory Society (E.R.S), της International Association for the Study of Lung Cancer (IASLC) και της European Society of Medical Oncology (ESMO).